分别开展了资源繁种和初评工作，对2009年未进行繁殖的种子进行繁种，并进行初步鉴定，评价筛选优异资源；对上年度繁殖后未达到入国家库种子量要求的资源，进行再次繁殖；果树、麦类、玉米和专题食用菌资源子专题已与课题主持单位中国农科院相关研究所达成了深入鉴定评价的具体方案。其余子专题根据初步鉴定出的优异资源情况，提出了开展深入鉴定评价工作的建议，部分子专题已开展了初步工作。对各次考察各队的采集清单进行合并，制定了基本信息数据库描述规范和数据标准，并进行数据标准化处理。对基本信息数据库中的数据项进行精简。按照已出版的数据标准，对资源进行了重新分类。最后形成包括13项数据项，共6910条记录的基本信息数据库。10个专题（麦类、豆类、玉米和杂粮、果树、蔬菜、甘蔗、茶叶、药用植物、热作、薯类）已取得性状鉴定数据并提交云南项目办（共有2000余份资源）。

但由于还缺少小部分基本信息数据项，发回各专题再次进行补充。完成了60个县的普查表和20个县的系统调查表的归档整理工作，尚有10个县的系统调查表的归档整理正在进行中。

在开远建立了7亩试验基地，种植了共计454份玉米资源。在弥勒试验点对1396余份稻种资源进行了形态学评价，调查性状包括株高，抽穗日期，主穗长，穗颈长，穗型，剑角，剑长，剑宽及抗倒伏性等性状，采集了62820个数据。利用分布于12条水稻染色体上的72对SSR引物对80份材料进行遗传多样性与相似性分析，共检测出277个等位基因，其中有效等位基因数201个，每对引物等位基因数在2～9之间，平均等位基因数为3.847个，平均有效等位基因数为2.789。

在西双版纳州进行2009年采集的32个水稻白叶枯病菌的接种鉴定，6月进行水稻白叶枯病菌接种后的症状调查，并判断其在鉴别寄主上的R或S。并搜索了4个白叶枯病菌与致病性相关的基因的全序列（hrpX基因，hrpG基因，hrpB2基因，hrpE基因），设计了4对引物序列进行这些基因的全序列扩增。菌株小种类型鉴定后，将进行这些基因的扩增，利用基因序列比对，分析致病型变异与这些基因的关系，这将从分子水平进一步探索水稻白叶枯病菌致病型变异的原因。开展了云南省版纳州及普洱市和保山市周边地区的作物种质资源收集，目前共收集到农作物种质资源112份，获得资源收集地区的农作物资源状况相关的信息。

繁殖小麦地方种质、新征育成品种及引进育种材料如中东山羊草、陕西节节麦、野生一粒、野生二粒、栽培一粒、栽培二粒、乌拉尔图、阿拉拉特、提莫菲维、东方小麦、波兰小麦、波斯小麦、茹科夫斯基小麦等76份；种植云南小麦等的F1及其他高代创新材料100份；新配制B1C1杂交组合等60个；筛选出优异单穗100余份。完成2009年繁殖的1329份种质的入库：其中杂粮270份（新征193份），包括荞麦115份（苦荞90，其中新征67份，新征甜荞25份）、谷子5份（新征）、籽粒苋30份（新征23份）、龙爪稷（穇子）21份（新征）、薏苡21份（新征12份）和高粱42份（新征40份）。稻种（韩国交换入种质）256份。

水稻地方种质更新入库458份。玉米345份，其中自交系13份、新编目107份、新收集并编目223份。按照云农院发[2009]145号文件规定，共接受全院种子作物种质资源入库保存78份，其中粮作所水稻两系课题引进水稻材料入库保存23份、玉米课题云优、云瑞等及地方玉米品种入库保存18份；园艺所大白菜、花菜、辣椒、番茄、洋葱及菜豆等37份入库保存。